指挥官对话的选择主要出现在剧情任务新纪之战中，玩家需要在漂泊者与指挥官之间做出选择。这一选择不会影响主线剧情的发展，但会影响玩家后续操作的角色形象以及部分对话细节。漂泊者和指挥官本质上共享记忆与能力，区别主要体现在外观和部分台词表现上。如果对外观有特定偏好，建议选择指挥官，因为漂泊者的模型可能存在随机体型变化，而指挥官的形象通常更稳定且可自定义程度更高。
关于专精学派的选择，游戏内提供了五个不同倾向的学派，分别是Zenurik、Madurai、Unairu、Naramon和Vazarin。Zenurik学派是较为通用的选择，它专注于能量恢复和控场能力，适合大多数战斗场景。该学派的活力冲刺技能能有效解决能量续航问题，而其他技能在持久战和团队辅助方面也有不错的表现。如果偏好输出，Madurai学派的高爆发伤害加成会更合适，但需要更高的操作熟练度来弥补能量消耗问题。
在完成灵魂纷争和萨娅的守望任务后，玩家需要前往赛特斯找到司书激活专精系统。初期建议优先点出Zenurik学派的能量恢复相关技能，其他学派的技能可以随着游戏进度逐步解锁。需专精技能的激活和升级需要消耗大量专精点数，因此前期资源有限时应合理分配，避免过早分散投资导致核心技能无法成型。专精系统的成长是一个长期过程，玩家可以通过重复刷取夜灵平原或高级地图来积累专精点数。
漂泊者与指挥官的状态在剧情设定上是互斥的，即玩家在同一时间只能操控其中一种形态。两者的切换需要通过虚空或特定剧情节点实现。从游戏机制来看，漂泊者的部分动作模组与指挥官略有不同，但实际战斗能力并无显著差异。如果已经完成新纪之战主线，玩家可以自由切换两者，具体操作方式是在飞船内使用相应的功能界面。对于追求剧情沉浸感的玩家，建议根据个人对角色的理解进行选择，而无需过度纠结性能差异。
最后指挥官对话和专精学派的选择并非永久固定，玩家可以通过重置专精或重新体验剧情任务进行调整。游戏鼓励玩家尝试不同组合以找到最适合自己的玩法风格。如果对当前选择不满意，可以投入时间解锁其他学派的技能或通过外观系统调整角色形象。星际战甲的核心体验在于多样化的战斗与成长路径，因此玩家可以放心按照个人偏好做出初始选择，后续再逐步探索其他可能性。
