解锁幽灵猎手支线需要先推进主线至第八章时间生物学家节点，在时间生物学家的终端接取次要订单109，任务内容为将袭击事件物证配送至位于时间生物学家营地山脚的幽灵猎手据点。该据点在地图上初始为未探索状态，沿河谷向东北方向行进即可找到，配送途中注意避开东侧山地的BT区域与零散的米尔人巡逻队。
完成109订单后幽灵猎手据点接入开罗尔网络，同时解锁次要订单110，也就是调查无头骑士的战斗任务。触发该任务有两个条件，必须在夜间抵达任务标记点，且必须驾驶三轮巡航摩托Tri-Cruiser到达，白天抵达或步行、驾驶卡车与骨架载具均无法触发剧情。若当前为白天可以在任意私人终端的休息舱选择睡眠至夜间，三轮摩托可以在附近的机械师据点制造，或在道路旁拾取其他玩家遗留的载具，出发前建议从发明家据点获取bola眩晕枪，同时携带机枪、突击步枪与霰弹枪，备足弹药与血袋。
抵达任务标记的红色自动铺路装置附近后会触发过场动画，随后进入载具追逐战斗阶段，山姆需要驾驶摩托应对多波无头骑士，清理数批红色摩托敌人后，会出现一名散发蓝色光芒的骑士，这是本次任务的核心目标，集中火力将其击败后再清理剩余敌人即可结束战斗。战斗结束后返回幽灵猎手据点交付任务，可以解锁“无头骑士揭秘”奖杯，同时据点声望提升至二星，解锁林地派送服与火箭箱武器。后续提升幽灵猎手的声望无法靠重复配送，需要完成对应声望等级解锁的专属次要订单，声望达到对应阈值时会通过SSS终端收到任务提示，二星后解锁次要订单111。
任务为前往据点西南侧的林火区域营救发出哭声的孩童，任务区域内遍布烟雾与火焰，需要携带防火装备与足量的治疗物品，沿哭声方向行进时注意躲避燃烧的倒塌物，抵达目标点后孩童会消失，仅留下特殊的chiral晶体，拾取后返回交付即可，完成后声望提升至三星。三星后解锁次要订单112，任务为将营救的琴鸟送至动物收容所，琴鸟属于易碎且易受惊吓的货物，运输过程中需要保持平稳，避免急加速急转向与剧烈颠簸，完成后可以获得对应点赞与物资奖励。四星前解锁次要订单113，任务为调查神秘移动的房屋并回收锈蚀的chiral晶体，该房屋会在区域内缓慢移动，需要追踪其轨迹找到入口，内部存在少量BT与环境陷阱，回收全部晶体后返回交付，完成后声望接近四星，解锁大容量手榴弹袋与对应布贴。
想要解锁最终的次要订单114与“揭开幽灵猎手之谜”隐藏成就，需要先通关全部主线剧情，主线结束后会出现卓布里吉丘比特连接器的开关选项，选择保持开启状态，之后返回幽灵猎手据点，会发现终端无法访问，与偶人对话后即可解锁隐藏成就，同时收到SSS提示的最终任务114。任务为前往终堡结点城应对虚空爆发，该任务难度较高，会出现巨型BT与大量浮游体，击败巨型BT后即可完成最终任务，将幽灵猎手声望提升至五星，解锁专属全息投影与对应布贴。
