万神殿的选择比较受到所处的环境和策略，通用的会是三个选择，当中会有收获女神、锻造和宗教移民，收获女神的选择能够增加额外的产出，能够使得早期的建造和扩张都得到快速增加，使得食物、生产力和金币的生产都会增强发展速度。锻造比较适合打造强大军事力的玩家，能够增加资源的产出，使得部队能够更快训练，优势能够快速占据。宗教上比较适合的会是快速扩张和建立城市的玩家，作用是增加城市的信仰，使得统治得到巩固。
中国的玩家还会有额外的三选择，分别会是皇帝、孔子和玉皇大帝，皇帝代表的会是指挥，作用是早期发展科技和建新科技时能够更快，孔子代表的会是道德和文化，选择后能够增加文化修养，使得市民的支持率能够得到增加。玉皇大帝会是宗教力量的象征，主要是通过宗教的力量来提升军事上的战力，或者是城市的防御力。
其它的选择会有技术、文化和生产力等，技术上主要是增加科技的研究速度和生产力，文化会是分数和影响的增加，能够增加声望和政治经济，生产力会是增加人口的增长，主要用到的会是经济主导的文明，能够保证粮食和城市都会得到发展。奇迹方面的选择能够增强建造的速度和效果，比较适合喜欢建造玩法的玩家，因为资源的产出和城市发展速度能够变快。
