沉底宝箱的位置需要解锁对应地图，地图的获得需要碰到寄居蟹隐士，在浅海钓鱼时会有几率开出瓶中信，这个信在没有遇到隐士时，会是月岛的提示位置。在遇到隐士后打开才能有宝箱的位置显示，但是具有概率性，通过把开裂珍珠交给隐士后，必定每次开启瓶中信得到的是宝箱位置消息。珍珠的获得会在帝王蟹身上，在刚开始战斗时，珍珠可以强化怪物，只有激化强化状态下的怪物，才能得到天体贡品。
珍珠随着战斗的结束，也会从完好形态变成破损状态。获得的地图位置存在最多只能十个，反复捞取掉在海里的宝箱，也不会造成印记增加，而且不去找的话能够一直存在，直到满10个后不会有新的生成。生成的方式有被海盗袭击后，穿上会有概率生成箱子，海洋纪念碑的情境中也会有一个，位置在生成后不会再发生改变。使用锤子锤击破坏后可以获得一些物品，箱子里最大能够容纳九个物品。
物品很大概率会是金块和宝石等各种资源，鹤嘴锄和海钓竿也算在其中，包括各种浮标、邪天翁的羽毛和古董船套装等。如果箱子没有装满，那么会有概率出现惊喜种子，种子的概率获得会随着天数增加而更高，但是会有上限，最大只能提到60%。常见的玩具地精爷爷、硬化橡胶塞和迷你火箭等，这些都会有几率出现，出现的数量只能一个。
