电系宝可梦的唯一致命弱点是地面系，地面系招式对电系造成双倍有效伤害，且电系招式无法命中地面系目标。
地面系之所以是电系的绝对克星，核心机制在于“导电”与“免疫”。在第一世代的属性规则中，地面属性对电属性拥有完全的伤害免疫，任何电系技能，即便是十万伏特这样的强力招式，打在地面系宝可梦身上都不会造成任何伤害，这在所有属性克制关系中是独一份的“无效”效果。实战里，面对三地鼠、铁甲犀牛这类地面系精灵，电系输出会被彻底化解，相当于完全无法破防，只能依靠物理攻击或其他属性招式应对。
除了地面系的绝对压制，岩石系也能对电系形成有效克制。岩石系招式对电系造成1.5倍有效伤害，配合部分岩石系宝可梦的高防御特性，能显著降低电系招式的威胁。比如大岩蛇、化石翼龙这类双属性精灵，既能抗住电系输出，又能用岩石系招式反击，在道馆战和联盟赛中是应对电系的优质选择。
电系宝可梦自身也存在不少抗性，能降低部分招式伤害，这在组队时可以巧妙利用。电系抵抗电系、飞行系和钢系，同类招式互打时伤害减半，飞行系招式命中也会大幅削弱。比如皮卡丘、雷丘内战时，双方输出效果都会打折扣，此时可搭配高速度招式抢占先机；面对飞行系宝可梦时，电系抗性能有效抵消部分伤害，同时电系招式对飞行系有双倍克制效果，可形成攻防兼备的搭配。
应对电系宝可梦，核心思路是优先派出地面系宝可梦作为主力counter。在道馆挑战或野外对战中，遇到雷火、闪电鸟等电系强者，直接切换三地鼠、大岩蛇等地面系精灵，既能免疫电系伤害，又能凭借高攻击招式快速压制对手。若没有地面系备选，可选择具备岩石系招式的宝可梦，或利用双属性优势（如岩+钢、地+钢）进一步提升抗性，同时注意保留高速控场招式，避免被电系宝可梦的麻痹效果限制行动。
