兵种搭配是决定战斗胜负的核心因素之一。兵种之间存在明确的克制关系，骑兵克制盾兵，盾兵克制弓兵，弓兵克制枪兵，枪兵克制骑兵，器械兵则主要用于攻城。理解并利用这种克制关系，能够在战斗中占据优势。武将的兵种适性同样重要，S级适性可发挥120%属性，A级适性为100%，B级适性仅80%，因此优先选择适性高的兵种搭配。
高武力武将如吕布、关羽适合骑兵或枪兵，利用其高爆发特性快速压制对手。谋略型武将如诸葛亮、周瑜更适合弓兵或器械兵，依靠战法进行远程输出或辅助。盾兵通常由高统率武将如曹操、徐晃担任，提供稳定的前排防御。兵种战法的搭配也需考虑，例如白马义从提升先攻概率，适合先手控制阵容，而藤甲兵能大幅减少兵刃伤害，但需注意规避火攻。
队伍的整体兵种搭配需平衡输出、防御和控制。纯输出阵容如三势吕依赖骑兵高速突击，但缺乏续航能力，容易被消耗型阵容拖垮。均衡型阵容如桃园队结合盾兵防御和枪兵输出，适应性更强。特殊阵容如仙人队凭借兵种适性加成，能灵活切换兵种应对不同敌人。兵种的选择还需考虑战场环境，例如山地地形会限制骑兵移动，而森林地形对弓兵的视野有影响。
实战中需根据敌方阵容动态调整兵种。若敌方以骑兵为主，可切换枪兵进行针对性克制。面对高谋略阵容时，藤甲兵的效果会大打折扣，改用陷阵营或青州兵更为稳妥。侦察敌方兵种配置是必要步骤，盲目出战可能导致不必要的战损。兵种克制并非绝对，战法联动和属性差距同样能扭转局势，因此需综合评估敌我实力后再做决策。
