潜行任务是游戏机制的重要组成部分，但玩家可以选择跳过或简化这些环节。跳过潜行任务会直接影响游戏体验和任务完成方式，部分剧情触发条件可能无法达成，甚至导致后续任务链断裂。游戏中的潜行设计不仅关乎资源获取和敌情侦查，还与角色成长和剧情推进紧密相关。若完全回避潜行玩法，玩家将失去对敌人营地布局和弱点的了解，增加正面冲突的难度。
跳过潜行任务后，玩家需依赖更直接的战斗手段。清理埋伏营地时，若不通过潜行暗杀削弱敌人，可能面临同时应对多名武装敌人的风险。游戏中的弹药和医疗资源有限，高强度正面冲突会加速资源消耗，迫使玩家频繁返回营地补充物资。部分任务目标如不被发现摧毁设备或解救俘虏会因跳过潜行而失败，需重复尝试或接受任务评级降低的结果。
从剧情角度分析，潜行任务往往包含关键线索和背景信息。跳过这些内容可能导致玩家对主线剧情的理解出现断层，尤其是涉及NERO研究和安息者阵营的支线任务。游戏中的录音带、文件等收集品通常隐藏在潜行路线中，跳过潜行会减少世界观构建的完整性。部分成就或奖杯如费尔维尔鬼影（100次潜行击杀）也无法完成，影响白金进度。尽管跳过潜行任务可行，但需权衡利弊。游戏为不同玩法提供了适应性设计，例如通过升级武器或摩托性能弥补潜行缺失的劣势。
