抵抗飞机攻击要结合单位布置、科技升级和战斗方法，优先选末日机甲和喷气式战斗机，辅助用防空车和巡洋舰构造多层防御，同时也能削弱对方空中势力，后期对战中灵活调整部队应对核弹等特殊攻击。常见陆地防空单位有防空车、防空导弹车，作为支援单位驻扎在关键城市或者战场附近，有效拦截敌人飞机，无需继承能够灵活布置，方便保护城市和地上军队。单位能进行升级，优选防空导弹车，有效提高拦截范围和成功。
末日机甲自带固定防空力量，海陆空三栖高机动，是顶级防空位。空中拦截战斗机，首选喷气式战斗机，自动拦截在攻击范围内的战斗机，升级后攻击增加战力提升，显著增加拦截概率。拦截范围是一格，需要提前规划部署位置。海上防御依靠导弹巡洋舰，有高数值对空力量，适合保护城市和舰队。另个是无敌舰队，进一步提升对空范围和攻击，适合协同作战。在边境城市或者重要地点、资源区集中防空单位，形成多层防御，比如在城市中心可用防空车和战斗机、末日机甲，沿海地带用导弹巡洋舰和战斗机形成防线。
削弱敌人空军源是最直接方式，摧毁机场、航空满母舰，常用突袭方式破坏，核弹虽然也能破坏，但负效果过多，更多作为震慑手段，破坏敌方飞机起降点后，有效减少空袭威胁。外交上通过谴责或者盟约限制对方发展，延缓对方空军升级。
