水底探索是游戏的重要环节，掌握潜水技巧和应对策略至关重要。潜水操作需要同时按住鼠标右键和B键实现下潜，若深度较大则需装备呼吸器延长水下活动时间。水下推进通过W键前进、S键后退配合左右方向键转向，合理利用地形规避障碍物是基本生存法则。水下道具如闪光灯能照亮黑暗区域，水下手枪等武器则用于应对突发战斗，但需注意氧气消耗速度与敌人攻击节奏的平衡。
水下关卡设计往往与水位升降机制紧密相关。以蓄水池洞穴为例，玩家需利用油桶炸开通水口改变水位，通过绳索箭连接木筏与机关控制水流方向。部分场景需要精确计算时间差，如在木筏靠近水车时快速跳跃至高台，或在水位下降瞬间穿过通道。水下谜题解法具有逻辑连贯性，通常需要先观察环境结构再分步实施操作，鲁莽行动可能导致氧气耗尽或触发陷阱。
呼吸器是深潜必备工具，可大幅延长水下停留时间；闪光灯能揭示隐藏通道位置，尤其在浑浊水域中作用显著。武器方面建议优先升级水下手枪的装弹速度，面对水下敌人时保持移动射击，避免陷入缠斗。资源管理方面，需提前在营地制作防水炸药等特殊道具，某些封闭区域需要爆破才能进入。
普通敌人可通过潜行绕开或近身速杀，而精英敌人建议引至开阔区域周旋。当遭遇多个敌人时，利用水下岩石作为掩体，优先解决远程攻击者。注意部分水域存在食人鱼等环境威胁，持续移动可降低被攻击概率。特殊场景如被淹没的档案室存在时间限制，必须规划最短路线快速通过。
