知比山雷霆探针解密的关键在于正确引导雷灵并激活探针。首先需要找到知比山地下的三个雷灵，它们分别位于山体不同位置。第一个雷灵在知比山传送点右下角的山缝中，第二个位于菅名山半山腰的树上，第三个则藏在无名山低矮处的石堆旁。引导雷灵时若跟丢，可传送至远处再返回，雷灵会重新刷新在起始点。
完成雷灵引导后，需前往知比山底部密室。此处墙壁带有雷鸟图案，使用羽毛道具可破除墙壁进入隐藏房间。房间内设有雷霆探针机关，需通过雷元素激活。推荐使用北斗的E技能或携带雷种子附着雷元素，站到探针指定位置使其指向正确方向。注意探针激活后需保持角色站位，避免移动导致指针偏移。
密室中还包含火把解谜，需根据天花板壁画提示点亮对应火把。4号壁画对应6个火把中的4个，5号壁画需点亮5个火把中的3个，6号壁画同样需点亮3个火把。解谜答案均可在壁画中找到，仔细观察亮星位置即可。完成火把解谜后，可开启精致宝箱并获得隐藏成就猜想时间。击败两波怪物后，墙壁消失可进入深处获取珍贵宝箱。此处角落雷鸟雕像使用羽毛会出现机关，开启后左侧水位再次下降，可拾取雷神瞳。
