清籁丸沉船的解密流程需要从船头甲板的罗盘机关开始。首先找到四个呈直角分布的罗盘，将指针调整为两两相对形成长方形即可触发木板断裂，船舱入口会开启。完成该步骤后建议先获取雷种子，用于解除后续遇到的若雷结界。船头桅杆处可通过雷种子飞行拿到第一个雷神瞳，船舱内部左侧还能发现第二个雷神瞳。
进入船舱后需跟随仙灵指引，途中会获得锈蚀的钥匙用于开启木门。在船舱内部存在两处关键解密：第一处是四个相同原理的罗盘机关，同样调整为指针两两相对；第二处是翻牌式地板解密，需要点亮两组图案相同的木板。完成这两处解密后会出现通往下一层的通道，同时能获得普通宝箱和珍贵宝箱各一个。
沉船第二层存在第二次翻牌解密，地板符号需按照特定顺序点亮。此处解密成功后会出现隐藏洞穴，跳下去可发现锁住的宝箱和新的机关。该区域需要收集两个继电石，参照特定位置摆放才能激活电路。完成全部机关后，沉船底部的铁门会自动开启，门内藏有华丽宝箱和第三个雷神瞳。
最终阶段需将仙灵引导至指定坐台，返回船尾区域可触发成就戴维-琼斯的箱子。整个解密过程中需注意三个雷神瞳的收集位置：桅杆顶部、船舱左侧篮子和铁门内。若遇到雷种子消失导致坠落的情况，建议重新获取雷种子后快速完成相位之门的传送操作。该解密任务共涉及三种机关类型：罗盘指针调整、地板符号匹配和继电石电路连接。建议优先完成船头部分再进入船舱，避免遗漏仙灵引导的关键步骤。
