隐藏先祖是探索的重要目标之一。晨岛的隐藏先祖有三个，分别位于断桥右侧的山洞、断桥下方以及神庙大门的左侧。需神庙左侧的山洞需要先解锁两个云野先祖才能进入。云野地图的隐藏先祖更多，共有八个，分布在溶洞口、双人门内、三座岛的蜡烛附近以及需要八人协作的圆环机关处。雨林的隐藏先祖则藏在树洞、河道桥下和密林遗迹的断树桩旁，部分需要烧掉黑暗植物或与好友配合才能解锁。
寻找隐藏先祖时，建议先熟悉地图布局。比如霞谷的隐藏先祖大多集中在滑冰场和霞光城，其中倒立先祖需要飞到城门栏杆处，后空翻先祖则藏在小亭子里。墓土的隐藏先祖通常分布在石柱后、平台高处或迷宫般的管道附近，部分需要避开冥龙巡逻。禁阁的隐藏先祖多在四人门或浮空岛上，白斗篷先祖就在双人门尽头的走廊里。
解锁隐藏先祖的技巧包括多观察环境细节。比如雨林的鲸语先祖藏在骸骨堆中，需要点燃黑暗植物；而禁阁的灵语者先祖需要两人协作开门。部分先祖的触发条件特殊，比如雨林树洞隐藏图需要和好友同时使用生气表情。如果遇到空气墙阻挡，可能是缺少对应地图的先祖数量，可以邀请已解锁的好友带你进入。
